标题:
依据TCGA数据库建立中国宫颈鳞癌患者淋巴结转移的分子预测模型
讲者:
段雅晨
单位:
复旦大学附属肿瘤医院
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论文摘要:
目的 对于宫颈癌患者淋巴结的切除,除影像学诊断外尚无准确的预测手段,其最佳治疗方法尚存在争议。我们建立了一个分子预测模型,能够对宫颈癌患者术中淋巴结的转移切除提供指导意见。
方法 本研究以TCGA数据库2015年发布的宫颈癌mRNA Seq数据为初步筛选数据库;接下来筛选出2010年至2011年在我院手术切除淋巴结的宫颈鳞状细胞癌患者204例,分为淋巴结转移组102人及淋巴结未转移组102人,进行配对分析。统计分析使用R语言软件及DEseq包,并通过lasso算法进行大数据公式拟合;采用SPSS 19.0对验证结果进行单因素分析及logistic回归分析。
结果 通过在TCGA数据库中的基因筛选,我们最终选择了7个基因在我院手术的患者中进行验证建模;针对临床宫颈癌可手术的患者,我们建立了一个淋巴结转移的分子预测模型,包括了以下三个基因:GLOD5(P=0.009)、LOC494141(P<0.001)及GML(P=0.020);单因素分析结果显示LOC494141(P=0.002)及GML(P=0.003)对宫颈癌患者淋巴结转移具有独立的预后意义;该公式在我院手术患者人群中的ROC工作曲线下面积为0.747。
结论 针对宫颈癌手术的患者,我们的模型可以对其淋巴结转移起到预测的作用,对患者的术后一般情况起到一定的改善作用。