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张丕红:正常皮肤、瘢痕和瘢痕癌组织中差异表达ncRNA的生物信息学分析 PPT讲座视频 中华医学会烧伤外科学分会2017年学术年会暨第二十五届全军烧伤外科学专业学术会议
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标题： 正常皮肤、瘢痕和瘢痕癌组织中差异表达ncRNA的生物信息学分析
讲者： 张丕红
单位： 中南大学湘雅医院
关键词：
瘢痕 瘢痕癌 发病机理 非编码RNA
播放： 2329
论文摘要： 目的：观察正常皮肤、瘢痕和瘢痕癌组织中差异表达的非编码RNA（LncRNA、miRNA），从非编码基因角度探索瘢痕癌的发病机理。  方法：采用Arraystar人长链非编码芯片v2.0 检测正常皮肤、瘢痕、瘢痕癌中差异表达的LncRNA、mRNA，miRNA二代测序技术检测三种组织中差异表达的miRNA，基因本体论(Gene Ontology, GO)和KEGG生物学通路分析预测差异表达LncRNA、miRNA的功能。  结果：与癌旁瘢痕组织相比，瘢痕癌中有840个LncRNA、2101个mRNA表达增强，2323个LncRNA、1415个mRNA表达减弱(fold ≥ 2.0, p < 0.05)，22个miRNA表达增强，20个miRNA表达减弱(fold ≥ 1.5, p < 0.05); 与正常皮肤组织相比，瘢痕癌中有1989个LncRNA、4534个mRNA表达增强，3369个LncRNA、1696个mRNA表达减弱(fold ≥ 2.0, p < 0.05)，10个miRNA表达增强，15个miRNA表达减弱(fold ≥ 1.5, p < 0.05)；其中，在瘢痕癌、癌旁瘢痕、正常皮肤组织差异表达的LncRNA和mRNA中，有110个LncRNA梯度表达增强，302个梯度表达减弱，289个mRNA梯度表达增强，149个梯度表达减弱(fold ≥ 2.0, p < 0.05)；GO分析显示cellular process、cell part、 protein binding、 biological regulation、 single-organism process、 organelle等富集比较多；KEGG分析显示与癌旁瘢痕组织相比,瘢痕癌中表达增强的LncRNA涉及43个信号通路，其中最明显的为p53 signaling pathway，表达减弱的LncRNA涉及44个信号通路其中最明显的为Chemokine signaling pathway，表达增强的miRNA涉及48个信号通路，其中最明显的为Insulin signaling pathway，表达减弱的miRNA涉及74个信号通路，其中最明显的为Pathways in cancer；与正常皮肤组织相比,瘢痕癌中表达增强的LncRNA涉及89个信号通路，其中最明显的为Protein processing in endoplasmic reticulum，表达减弱的LncRNA涉及44个信号通路其中最明显的为Melanogenesis，表达增强的miRNA涉及13个信号通路，其中最明显的为Colorectal cancer，表达减弱的miRNA涉及74个信号通路，其中最明显的为Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells。结论：正常皮肤、瘢痕、瘢痕癌组织中差异表达的非编码RNA（包括LncRNA、miRNA）可能在瘢痕形成以及瘢痕癌变过程中发挥重要作用。
 
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张丕红

烧伤外科

中南大学湘雅医院


主任医师，教授，博士生导师，中南大学湘雅医院烧伤整形外科主任，中华医学会烧伤外科分会常委，中国医师协会烧伤医师分会常委、创面修复专委会常委，中国老年医学学会烧创伤分会副会长，中国医促会烧伤医学分会副主委、创面修复与再生医学分会常委，中国研究型医院学会烧创伤修复重建与康复专委会副主委，《中华烧伤与创面修复杂志》和《中华损伤与修复杂志（电子版）》常务编委，湖南省烧伤与修复重建专委会主委。承担国家自然科学基金课题多项，在大面积烧伤感染、脏器损害的防治以及电烧伤等深度创面皮瓣修复、瘢痕整复等方面积累了较丰富的临床经验，荣获第三届 “国之名医?优秀风范”称号。

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